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WB電泳之關于蛋白定量的一些問題探討

[導讀]蛋白定量首先需要一個參照系(標準蛋白),參照蛋白通常選擇BSA,也就是說你所謂的定量是對應于BSA的濃度的一個參照值。這里面存在一個問題,即忽略了蛋白折疊和空間構象對光吸收、折射的影響;不同的蛋白折疊和構象還會影響顏料分子的嵌入。

裂解組織或細胞的時候,那些裂解液中,某些溶劑本身會使CoomassieG250或者Bradford法(實際也是Coomassie染色)顯色,尤其是去污劑之類;例如NP40,就會使Coomassie顯藍色,可以完全覆蓋掉蛋白與Coomassie作用產生的藍色。因此,如果你的裂解液里面含有這類物質,所謂的蛋白定量實際是NP40顏色和蛋白染色的疊加,根本不會符合標準蛋白曲線的線性規律,自然定不準。你從制備樣品時就注意過定量問題,通常內參差別不會太大。如果真的有差別,通常我們會先跑少量的樣品,目的是讓Actin或tubulin更清晰、不會粘連、不會過曝光。從而在第二輪跑正式結果前,根據第一輪的內參的熒光信號做微調,大致能做到相當;最多可能需要第三輪。以上的試驗可以精確到0.1ul差異

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