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DNA核酸濃度的測定方法之超微量紫外分光法

[導讀]紫外分光光度法基于DNA鏈上堿基的苯環結構在紫光區具有較強吸收,DNA/RNA在260nm處有最大的吸收峰,蛋白質在28Onm處有最大的吸收峰,鹽和小分子則集中在230nm處。因此,可以用260nm波長進行分光測定核酸濃度,OD值為1相當于大約50ug/ml雙鏈 DNA,單鏈DNA濃度約為33ug l ml,RNA約為40ug/ml,寡核苷酸約為35ug/ml。

A280nm是蛋白和酚類物質最高吸收峰的吸收波長,比值可進行核酸樣品純度評估:純DNA的A260/A280比值為1.8,純RNA為2.0。假如比值低,表示受到蛋白(芳香族)或分類物質的污染,需要純化樣品。比值=1.5相當于50%蛋白質/DNA溶液。A230nm是碳水化合物最高吸收峰的吸收波長,比值可進行核酸樣品純度評估:純DNA和RNA的A260/A230比值為2.5。若比值小于2.0標明樣品被碳水化合物(糖類)、鹽類或有機溶劑污染,需要純化樣品。

A320nm或A340nm為檢測溶液樣品的濁度,該值應該接近0.0。假如不足,標明溶液中有懸浮物,需要純化樣品。

A260/A280比值可提供DNA純度的一個參考,但A260/A280比值會受pH影響。如果未調pH,比值可能與實際近期將陸續推出一批全新的分析類儀器。差別很大。如果需要準確數值,建議在10 mM Tris Cl,pH 8.5中檢測,此時純凈的 DNA A260/A280比值應為1.8-2.0(注意應使用同樣緩沖液作為對照)

在測試時,離子濃度太高,也會導致讀數漂移,因此建議使用pH值一定、離子濃度較低的緩沖液,如TE,可大大穩定讀數。樣品的稀釋濃度同樣是不可忽視的因素:由于樣品中不可避免存在一些細小的顆粒,尤其是核酸樣品。這些小顆粒的存在干擾測試效果。為了最大程度減少顆粒對測試結果的影響,要求核酸吸光值至少大于0.1A,吸光值最好在0.1-1.5A。在此范圍內,顆粒的干擾相對較小,結果穩定。從而意味著樣品的濃度不能過低,或者過高(超過光度計的測試范圍)。最后是操作因素,如混合要充分,否則吸光值太低,甚至出現負值;混合液不能存在氣泡,空白液無懸浮物,否則讀數漂移劇烈;必須使用相同的比色杯測試空白液和樣品,否則濃度差異太大;換算系數和樣品濃度單位選擇一致;不能采用窗口磨損的比色杯;樣品的體積必須達到比色杯要求的最小體積等多個操作事項。

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